Le clocher de l’église a un rôle particulier à jouer en matière de protection de la nature. En effet, il abrite depuis 2008 un nichoir pour la chouette effraie, bien nommée Effraie des clochers. Ce nichoir avait été occupé par une colonie d’abeilles, et il était nécessaire de remplacer le nichoir, devenu trop attractif pour d’autres abeilles qui risquaient de s’y réinstaller à l’occasion des périodes d’essaimage.
L’association Atena 78 a donc remplacé en automne 2019 un nichoir neuf, prêt à accueillir les nichées de cette chouette que l’on voit parfois circuler la nuit aux abords du village, chassant les petits rongeurs qui peuplent les prés et les champs.
La commune de Villette participe ainsi à un réseau de communes hébergeant dans leurs clochers ces nichoirs, auxquels s’ajoutent les nichoirs installés dans de nombreux hangars agricoles.